Zgodnie z konkordatem papież Pius IX erygował 3 X 1861 metropolię Port-au-Prince z sufraganiami Cap Haïtien, Les Cayes, Port-de-Paix i Gonaïves; pierwszy metropolita, arcybp Martia Testard du Cosquer (1864–69), sprowadził z Francji wielu księży, m.in. monfortanów. Pod koniec XIX w. proces rechrystianizacji wyspy przerwały gwałtowne zmiany rewolucyjne, na kilka lat zerwano konkordat. W 1948 École Apostolique (zał. 1922) stała się pierwszym seminarium duchownym. Prześladowania dotknęły Kościół katol. za rządów prez. F. Duvaliera (1957–71) oraz jego następcy, J.-C. Duvaliera (1971–86); na krótko do normalizacji w stosunkach między państwem i Kościołem przyczyniła się pielgrzymka Jana Pawła II (9 III 1983); 1984 rozpoczęły się nowe prześladowania. Po obaleniu dyktatury Duvaliera XII 1987 i II 1988 doszło do konfliktów wewn. i rozlewu krwi; kryzysu polit. nie przełamały wybory 1990, kiedy to prezydentem został J.-B. Aristide, duchowny katol., reprezentant Frontu Nar. (obalony 1991 przez juntę wojsk., przywrócony w wyniku pokojowej interwencji sił międzynar., gł. USA, 1994). Obecnie Kościół katol. na H. podzielony jest na 2 metropolie, Cap Haïtien i Port-au-Prince, w skład których wchodzi 257 parafii. W 2. poł. XIX w. misje na H. prowadzili amer. baptyści; gwałtowny rozwój wspólnot protest. nastąpił po II wojnie świat., kiedy to na terenie H. powstało ponad 40 wspólnot, używających w liturgii języka kreolskiego.